腸道全菌群多樣性健康咨詢 Intestinal Microflora Diversity Analysis and Consulting
DGGE等分子生物學(xué)方法及生物芯片對(duì)腸道菌群進(jìn)行研究存在一定的缺陷。如DGGE只能檢測(cè)到環(huán)境樣品中十幾種優(yōu)勢(shì)菌，但是對(duì)痕量微生物卻束手無(wú)策。DCGE中，電泳條帶中包含不只一種16SrDNA序列，要獲悉具體的菌種信息，還需進(jìn)行克隆、測(cè)序，實(shí)驗(yàn)操作繁瑣；此外，采用這種方法不能反映微生物的豐度情況。而生物芯片通過(guò)固定在芯片上的探針來(lái)獲得微生物多樣性的信息，“只能驗(yàn)證已知，卻無(wú)法探索未知”，通過(guò)信號(hào)強(qiáng)弱判斷微生物的豐度也不是非常的準(zhǔn)確。新一代高通量測(cè)序技術(shù)以其數(shù)字化信號(hào)、高數(shù)據(jù)通量、高測(cè)序深度、高準(zhǔn)確率等特點(diǎn)，已被廣泛的應(yīng)用于腸道菌群的研究中。高通量測(cè)序法分析菌群可以分析包括痕量微生物在內(nèi)的大多數(shù)菌種，也能發(fā)現(xiàn)菌群中未知菌種，數(shù)據(jù)準(zhǔn)確全面可靠。
■分析項(xiàng)目：
●腸道細(xì)菌菌群多樣性(香農(nóng)曲線)；
●腸道細(xì)菌Top20菌屬分析(可以擴(kuò)展到前50種)；
●腸道細(xì)菌各主要菌群的含量排序；
●主要有益和有害菌的分析、綜合健康建議;
■分析樣品
10克新鮮或妥善保存的糞便；
■采樣注意事項(xiàng)：
需要按指導(dǎo)說(shuō)明操作；
■報(bào)告周期：15-20天
腸道菌群多樣性：
用來(lái)分析腸道菌屬種類(lèi)是否多樣的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法，式整體上對(duì)菌群情況的分析。橫坐標(biāo)代表測(cè)序讀數(shù)OTU的序數(shù)，縱坐標(biāo)代表該測(cè)序OTU的豐度值；每條折線代表某一物種的測(cè)序讀數(shù)OTU豐度分布，每種物種的豐富程度由曲線在橫軸上的長(zhǎng)度來(lái)反映，曲線跨度越大表示物種的組成越豐富；物種組成的均勻程度由曲線的形狀來(lái)反映，曲線越平坦，表示總體物種組成的均勻度越高。
16srDNA測(cè)序：
16SrDNA分析，是指用利用細(xì)菌16SrDNA序列測(cè)序的方法對(duì)細(xì)菌進(jìn)行種屬分析。包括細(xì)菌基因組DNA提取、16SrDNA特異引物PCR擴(kuò)增、擴(kuò)增產(chǎn)物純化、DNA測(cè)序、序列比對(duì)等步驟。是一種快速獲得細(xì)菌種屬信息的方法。
常見(jiàn)的益生菌和有害種屬：
幾種常見(jiàn)有益菌和常見(jiàn)有害菌按照菌的屬（細(xì)菌分類(lèi)有門(mén)、綱、目、科、屬、種等級(jí)）。乳桿菌屬 Lactobacillus、雙歧桿菌屬 Bifidobacterium、大腸埃希氏菌Escherichia、檸檬酸桿菌屬Citrobacter為常見(jiàn)無(wú)害的菌群種類(lèi)；其中乳桿菌和雙歧桿菌為常見(jiàn)的益生菌。韋氏梭菌(Clostridium Wellchii)、葡萄球菌Staphylococcus、變形桿菌proteus species、假單胞菌Pseudomonada- ceae、韋榮氏球菌屬 Verllonella、肺炎克雷伯菌 klebsiella pneumoniae為常見(jiàn)可能出現(xiàn)有害菌的菌屬。志賀氏菌屬 Shigella Castellani、 沙門(mén)菌屬Salmonella 為著名有害菌屬。
分析后干預(yù)：
1）補(bǔ)充必要的商業(yè)化益生菌：缺少雙歧桿菌屬的補(bǔ)充雙歧桿菌屬，缺少乳桿菌的可以合理補(bǔ)充嗜酸乳桿菌等乳桿菌、植物乳桿菌類(lèi)益生菌。
2）腸道菌群alpha多樣性下降的人群合理多樣化飲食；
3）腸道菌群alpha多樣性下降的人群合理其他腸道營(yíng)養(yǎng)如谷氨酰胺、N-乙酰氨基葡萄糖、腸道消炎補(bǔ)充劑、短鏈脂肪酸等腸道營(yíng)養(yǎng)加快健康腸穩(wěn)態(tài)的形成；
4）如發(fā)現(xiàn)潛在或重要有害菌，作為醫(yī)生治療腸道疾病的重要參考；
此分析可提供的重要信息如下：
●腸道細(xì)菌菌群多樣性；
●腸道細(xì)菌Top20菌屬分析；
●腸道細(xì)菌各主要菌群的含量排序；
●主要有益和有害菌的分析；
●分析后健康建議；
檢測(cè)報(bào)告報(bào)告范例：
說(shuō)明：幾種常見(jiàn)有益菌和常見(jiàn)有害菌按照菌的屬（細(xì)菌分類(lèi)有門(mén)、綱、目、科、屬、種等級(jí)）。乳桿菌屬 Lactoba- cillus、雙歧桿菌屬 Bifidobacterium、大腸埃希氏菌Escherichia、檸檬酸桿菌屬Citrobacter為常見(jiàn)無(wú)害的菌群種類(lèi)； 其中乳桿菌和雙歧桿菌為常見(jiàn)的益生菌。韋氏梭菌(Clostridium Wellchii)、葡萄球菌Staphylococcus、變形桿菌proteus species、假單胞菌Pseudomonadaceae、韋榮氏球菌屬 Verllonella、肺炎克雷伯菌 klebsiella pneumoni- ae為常見(jiàn)可能出現(xiàn)有害菌的菌屬。志賀氏菌屬 Shigella Castellani、 沙門(mén)菌屬 Salmonella 為著名有害菌屬。
主要20種菌簡(jiǎn)要分析（此分析將根據(jù)個(gè)人差異進(jìn)行智能化個(gè)性分析）
檢測(cè)指標(biāo)與簡(jiǎn)明分析：
1.雙歧桿菌Bifidobacterium,常見(jiàn)的一種益生菌,具有抗腫瘤、增強(qiáng)免疫、改善胃腸道、抗衰老作用，占42.86%;
2.擬桿菌屬Bacteroides，化能有機(jī)營(yíng)養(yǎng)的專性厭氧桿菌，占14.81%;
3.瘤胃菌屬 Ruminococcaceae_UCG-014, 凝固型苦蕎酸奶降低此菌豐度；合生元治療慢性功能性便秘后此菌豐度上升，黃芩湯對(duì)潰瘍性結(jié)腸炎大鼠治療后，此菌豐度增加，占9.86%;
4.普氏糞桿菌Faecalibacterium，可以產(chǎn)生丁酸，一般具有抗炎作用，占6.73%;
5.扭鏈瘤胃球菌 Lachnospira,為一種潛在的有益菌, 可發(fā)酵葡萄糖的產(chǎn)物包括甲酸、乳酸、乙酸、乙醇、CO2和H2。發(fā)酵果膠的產(chǎn)物與葡萄糖的相同并產(chǎn)甲醇。幼兒若此菌豐度過(guò)低，在3歲時(shí)更容易被診斷患有哮喘，占3.13%;
6.[Eubacterium]_rectale_group菌，目前研究較少，功能未知，占2.29%
7.另枝菌屬 Alistipes,與氧化三甲胺TMAO有關(guān)，也與腸易激綜合癥相關(guān)，占1.77%;
8.巴恩斯氏菌Barnesiella，可促進(jìn)環(huán)磷酰胺誘導(dǎo)的治療性免疫調(diào)節(jié)效果，占1.6%;
9.瘤胃球菌科Ruminococcus_2，合生元治療慢性功能性便秘后此菌豐度降低，占1.59%;
10.副桿菌屬Parabacteroides，生酮飲食提高Parabacteroides菌的豐度，科學(xué)家們懷疑這種細(xì)菌是提供抗癲癇保護(hù)的關(guān)鍵；此菌與腸易激綜合癥負(fù)相關(guān)，占1.58%;
11.真桿菌屬成員[Eubacterium]_coprostanoligenes_group，一種產(chǎn)糞甾醇真細(xì)菌，它能將膽固醇分解為不能被吸收的糞甾醇,隨著糞便排出體外，糞甾醇的比例能達(dá)到50%。這就意味著，腸道內(nèi)有此產(chǎn)糞甾醇真細(xì)菌的人吃下高膽固醇食物后吸收的部分比其他人要少一半，占1.4%;
12.瘤胃菌科Ruminococcus_1，此菌在相對(duì)豐度顯著在腎結(jié)石患者中顯著降低，占1.21%;
13.罕見(jiàn)小球菌屬 Subdoligranulum,來(lái)自人類(lèi)排泄物中的新屬，該菌體能利用許多糖類(lèi)物質(zhì)（即N-乙酰-D-葡萄糖胺，N-乙酰-D-甘露糖胺等可腸道內(nèi)發(fā)酵產(chǎn)生短鏈脂肪酸，是益生菌，占0.93%;
14.凸腹真桿菌[Eubacterium]_ventriosum_group，孕期增重過(guò)量人群此菌減少，占0.91%;
15.考拉桿菌屬 Phascolarctobacterium,通常是一種有益的菌，此菌豐度高的人容易減肥，占0.81%;
16.柯林斯氏菌 Collinsella,與脂質(zhì)代謝異常、II型糖尿病正相關(guān)，占0.72%;
17.薩特氏菌屬Sutterella，超過(guò)一半的伴有胃腸功能障礙的自閉癥兒童腸道中發(fā)現(xiàn)此菌，此外此菌在腹瀉動(dòng)物模型中顯著上升，占0.59%;
18.鏈型桿菌屬Catenibacterium，慢性功能性便秘患者中此菌減少。高心血管風(fēng)險(xiǎn)的患者腸道缺少此菌；此菌在終末期腎病患者中顯著減少；多囊卵巢綜合征患者腸道中此菌和Kandleria菌屬豐度增加；長(zhǎng)期在島嶼上的老年婦女體內(nèi)容易富集此菌；黎族人腸道容易富集此菌，占0.57%；
19.真桿菌屬成員[Eubacterium]_ruminantium_group，反芻動(dòng)物真桿菌，對(duì)機(jī)體有營(yíng)養(yǎng)、生物拮抗和維持腸道微生態(tài)平衡功能, 慢性功能性便秘患者腸道此菌增多，占0.48%;
20.毛螺菌科Lachnospiraceae的一種未分類(lèi)菌Lachnospiraceae_unclassified, 一類(lèi)通常在人類(lèi)腸道和其他的哺乳動(dòng)物腸道中發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌，占0.42%;
3.3菌群個(gè)性化綜合分析:
本次總讀數(shù)為68562，達(dá)到測(cè)序極限，分析樣品排名前20的菌屬見(jiàn)18頁(yè)。
將菌群多樣性分為“差，一般，良好，好，非常好”，則該個(gè)體腸道菌群整體菌屬的種類(lèi)一般，多樣性一般；
就熟知的有益菌而言，如雙歧桿菌屬等含量非常高，與長(zhǎng)期補(bǔ)充單一富含此菌的益生菌有關(guān)，但其他常見(jiàn)的益生菌屬如考拉桿菌、乳桿菌等也缺少。雙歧桿菌是一種生理性有益菌，對(duì)人體健康具有生物屏障、營(yíng)養(yǎng)作用、抗腫瘤作用、免疫增強(qiáng)作用、改善胃腸道功能、抗衰老等多種重要的生理功能。調(diào)整腸道菌群平衡，抑制腸道不良微生物的增殖。嗜酸乳桿菌對(duì)致病微生物具有拮抗作用。嗜酸乳桿菌能分泌抗生物素類(lèi)物質(zhì)(嗜酸乳菌素(acidolin)、嗜酸桿菌素(acidophilin)、乳酸菌素(laetocidon), 對(duì)腸道致病菌產(chǎn)生的拮抗作用。
此雖然個(gè)體也含有一些其他常見(jiàn)的有益的菌屬，如普氏糞桿菌Faecalibacterium，總體而言，各類(lèi)有益菌屬種類(lèi)多樣性不夠。建議還可以補(bǔ)充嗜酸乳桿菌等乳桿菌、植物乳桿菌等多種已有的商品化益生菌; 同時(shí)，合理選擇富含膳食纖維的食物和合理使用各種益生元，盡快促進(jìn)健康腸穩(wěn)態(tài)的建立。
測(cè)序分析表明該個(gè)體含有的常見(jiàn)潛在有害菌屬較少。測(cè)序結(jié)果還提示，該個(gè)體與II型糖尿病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)菌屬很多；與肥胖、腸易激綜合癥、中風(fēng)，慢性腎病，便秘風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的菌屬也較多，建議用戶加強(qiáng)此類(lèi)病的預(yù)防和健康管理。綜合以上分析，建議個(gè)體采取有力措施，維持腸道菌群的多樣性。
